Hönnunarkerfi og lausn fjölpeptíð peptíðkeðju

I. Samantekt
Peptíð eru sérstakar stórsameindir þannig að raðir þeirra eru óvenjulegar í efna- og eðlisfræðilegum eiginleikum.Sum peptíð er erfitt að búa til, á meðan önnur eru tiltölulega auðvelt að búa til en erfitt að hreinsa.Hagnýta vandamálið er að flest peptíð eru örlítið leysanleg í vatnslausnum, þannig að í hreinsun okkar verður samsvarandi hluti vatnsfælna peptíðsins að vera leyst upp í óvatnslausum leysum. Þess vegna er líklegt að þessi leysiefni eða jafnalausnir séu í miklu ósamræmi við notkun líffræðilegra tilraunaaðferða, þannig að tæknimönnum er stranglega bannað að nota peptíðið í eigin tilgangi, þannig að eftirfarandi eru nokkrir þættir í hönnun peptíða fyrir vísindamenn.

Hönnunarkerfi og lausn fjölpeptíð peptíðkeðju
Í öðru lagi, rétt val á tilbúnum erfiðum peptíðum
1. Heildarlengd niðurstýrðra raða
Auðveldara er að fá peptíð með minna en 15 leifum vegna þess að stærð peptíðsins eykst og hreinleiki hráafurðarinnar minnkar.Þar sem heildarlengd peptíðkeðjunnar eykst umfram 20 leifar, er nákvæmt magn vöru lykilatriði.Í mörgum tilraunum er auðvelt að fá óvænt áhrif með því að lækka fjölda leifanna niður fyrir 20.
2. Fækkaðu vatnsfælnum leifum
Peptíð með miklu yfirgnæfandi magni af vatnsfælnum leifum, sérstaklega á svæðinu 7-12 leifar frá C-endanum, valda venjulega efnafræðilegum erfiðleikum.Þetta er litið á sem ófullnægjandi samsetningu einmitt vegna þess að B-falt blað fæst í myndun.„Í slíkum tilfellum getur verið gagnlegt að breyta fleiri en tveimur jákvæðum og neikvæðum leifum, eða setja Gly eða Pro í peptíðið til að opna peptíðsamsetninguna.
3. Niðurstilling á „erfiðum“ leifum
„Það er fjöldi Cys-, Met-, Arg- og Try leifar sem eru almennt ekki tilbúnar auðveldlega.Ser verður venjulega notað sem óoxandi valkostur við Cys.
Hönnunarkerfi og lausn fjölpeptíð peptíðkeðju

Í þriðja lagi, bæta rétt val á leysanlegt í vatni
1. Stilltu N eða C endastöðina
Miðað við súr peptíð (þ.e. neikvætt hlaðin við pH 7), er sérstaklega mælt með asetýleringu (N-enda asetýlering, C endastöð sem heldur alltaf frjálsum karboxýlhópi) til að auka neikvæðu hleðsluna.Hins vegar, fyrir basísk peptíð (þ.e. jákvætt hlaðin við pH 7), er sérstaklega mælt með amínering (frír amínóhópur á N-endanum og amínun í C-endanum) til að auka jákvæða hleðsluna.

2. Stytta eða lengja röðina til muna

Sumar raðirnar innihalda mikinn fjölda vatnsfælna amínósýra eins og Trp, Phe, Val, Ile, Leu, Met, Tyr og Ala o.s.frv. Þegar þessar vatnsfælnu leifar fara yfir 50% er yfirleitt ekki auðvelt að leysa þær upp.Það getur verið gagnlegt að lengja röðina til að auka enn frekar jákvæða og neikvæða pól peptíðsins.Annar kosturinn er að minnka stærð peptíðkeðjunnar til að auka jákvæða og neikvæða pólinn með því að minnka vatnsfælin leifar.Því sterkari sem jákvæðar og neikvæðar hliðar peptíðkeðjunnar eru, því meiri líkur eru á að hún bregðist við vatni.
3. Settu í vatnsleysanlega leifar
Fyrir sumar peptíðkeðjur getur samsetning nokkurra jákvæðra og neikvæðra amínósýra bætt vatnsleysni.Fyrirtækið okkar mælir með því að N-enda eða C-enda súrra peptíða sé sameinuð með Glu-Glu.N eða C endastöð grunnpeptíðsins var gefin upp og síðan Lys-Lys.Ef ekki er hægt að setja hlaðna hópinn er Ser-Gly-Ser einnig hægt að setja í N eða C endastöðina.Hins vegar virkar þessi aðferð ekki þegar ekki er hægt að breyta hliðum peptíðkeðjunnar.