Það eru til margar tegundir af transhimnu peptíðum og flokkun þeirra byggist á eðlisfræðilegum og efnafræðilegum eiginleikum, uppruna, inntökuaðferðum og lífeðlisfræðilegum notkun.Samkvæmt eðlis- og efnafræðilegum eiginleikum þeirra er hægt að skipta himnugengandi peptíðum í þrjár gerðir: katjónísk, amfísækin og vatnsfælin.Katjónísk og amfísækin himnupeptíð eru 85% á meðan vatnsfælin himnugeng peptíð eru aðeins 15%.
1. Katjónískt himnugengt peptíð
Katjónísk transhimnupeptíð eru samsett úr stuttum peptíðum sem eru rík af arginíni, lýsíni og histidíni, eins og TAT, Penetratin, Polyarginine, P22N, DPV3 og DPV6.Meðal þeirra inniheldur arginín guanidín, sem getur vetnistengd við neikvætt hlaðna fosfórsýruhópa á frumuhimnunni og miðlað transhimnupeptíðum inn í himnuna við skilyrði lífeðlisfræðilegs PH gildi.Rannsóknir á oligarginíni (frá 3 R til 12 R) sýndu að himnunargeta náðist aðeins þegar magn arginíns var allt niður í 8 og himnunargeta jókst smám saman með aukningu á magni arginíns.Lýsín, þó katjónískt eins og arginín, inniheldur ekki gúanidín, þannig að þegar það er til eitt og sér er skilvirkni himnunnar ekki mjög mikil.Futaki o.fl.(2001) komust að því að aðeins væri hægt að ná góðum himnugengsáhrifum þegar katjónískt frumuhimnupeptíð innihélt að minnsta kosti 8 jákvætt hlaðnar amínósýrur.Þrátt fyrir að jákvætt hlaðnar amínósýruleifar séu nauðsynlegar til að penetrating peptíð komist inn í himnuna, eru aðrar amínósýrur jafn mikilvægar, svo sem þegar W14 stökkbreytist í F, glatast penetratin gegndrægni.
Sérstakur flokkur katjónískra transhimnupeptíða eru kjarnastaðsetningarraðir (NLS), sem samanstanda af stuttum peptíðum sem eru rík af arginíni, lýsíni og prólíni og hægt er að flytja þau til kjarnans í gegnum kjarnahola flókið.Hægt er að skipta NLS frekar í eina og tvöfalda gerð, sem samanstanda af einum og tveimur klösum af basískum amínósýrum, í sömu röð.Til dæmis, PKKKRKV frá simian veiru 40(SV40) er einfaldur NLS, en kjarnaprótein er tvöfaldur vélritun NLS.KRPAATKKAGQAKKKL er stutta röðin sem getur gegnt hlutverki í himnu gegnum himnu.Vegna þess að flest NLS hafa hleðslutölur minna en 8, eru NLS ekki áhrifarík yfirhimnupeptíð, en þau geta verið áhrifarík yfirhimnupeptíð þegar þau eru samgild tengd vatnsfælin peptíðröð til að mynda amfífækin yfirhimnupeptíð.
2. Amfiphilic transmembrane peptíð
Amphiphilic transmembrane peptíð samanstanda af vatnssæknum og vatnsfælnum lénum, sem má skipta í aðal amphiphilic, secondary α-heical amphiphilic, β-folding amphiphilic og prólín-auðgað amphiphilic.
Amfiphilic slit himnupeptíð í tveimur flokkum, flokkur með NLS sem eru samgild tengd með vatnsfælin peptíð röð, svo sem MPG (GLAFLGFLGAAGSTMGAWSQPKKKRKV) og Pep - 1 (KETWWETWWTEWSQPKKRKV), Báðir eru byggðir á kjarnastaðsetningarmerkinu PKKKRKV sem SV4bKKKRKV af vatnsfælni lén MPG er tengt samrunaröð HIV glýkópróteins 41 (GALFLGFLGAAGSTMG A), og vatnsfælna lén Pep-1 er tengt tryptófan ríkum klasanum með mikla himnusækni (KETWWET WWTEW).Hins vegar eru vatnsfælin lén beggja tengd við kjarnastaðsetningarmerki PKKKRKV í gegnum WSQP.Annar flokkur aðal amfífískra transhimnupeptíða var einangraður úr náttúrulegum próteinum, eins og pVEC, ARF(1-22) og BPrPr(1-28).
Auka α-heilical amphiphilic transmembrane peptíðin bindast himnunni í gegnum α-helices, og vatnssæknar og vatnsfælin amínósýruleifar þeirra eru staðsettar á mismunandi yfirborði helical uppbyggingu, eins og MAP (KLALKLALK ALKAALKLA).Fyrir amfísæka slithimnu af beta-peptíð-foldargerð, er hæfni þess til að mynda beta-plíserað lak afgerandi fyrir gegnumbrotsgetu hans í himnuna, eins og í VT5 (DPKGDPKGVTVTVTVTVTGKGDPKPD) í því ferli að rannsaka gegnumgengnisgetu himnunnar, með því að nota gerð D - Amínósýrustökkbreytingar hliðstæður gátu ekki myndað beta-brotið stykki, gegnumbrotsgeta himnunnar er mjög léleg.Í prólínauðguðu amfísæku transhimnupeptíðum myndast pólýprólín II (PPII) auðveldlega í hreinu vatni þegar prólín er mjög auðgað í fjölpeptíðbyggingunni.PPII er örvhentur helix með 3,0 amínósýruleifum í hverri umferð, öfugt við hefðbundna hægri handar alfa-helix uppbyggingu með 3,6 amínósýruleifum í hverri umferð.Prólínauðguð amfísækin transhimnupeptíð innihéldu nautgripapeptíð 7(Bac7), tilbúið fjölpeptíð (PPR)n(n getur verið 3, 4, 5 og 6) o.s.frv.
3. Vatnsfælin himnugengt peptíð
Vatnsfælin yfirhimnupeptíð innihalda aðeins óskautaðar amínósýruleifar, með nettóhleðslu sem er minni en 20% af heildarhleðslu amínósýruröðarinnar, eða innihalda vatnsfælin hluta eða efnahópa sem eru nauðsynlegir fyrir yfirhimnu.Þótt oft sé litið framhjá þessum frumu transhimnu peptíðum, þá eru þau til, eins og fibroblast growth factor (K-FGF) og fibroblast growth factor 12(F-GF12) frá Kaposi sarkmeini.
Pósttími: 19. mars 2023